1951年，加州州議會成立了26人的San Francisco Bay Area Rapid Transit Commission (舊金山灣區捷系統運委員會)，成員為來自灣區九個縣的州議員，針對環境問題，研究灣區的長期交通運輸需求，並提出解決方案。他們在1957年的報告中指 出，不論哪種交通運輸計劃都必需顧及整個灣區的未來發展。又說，若要灣區維持其良好適合居住及工作的環境，快速的交通運輸系統便不能完全倚賴汽車及高速公 路。他們認為最省錢的方法，便是劃定五個縣，建造高速的捷運鐵軌網路，將大城市的主要商業區與郊區商業中心連接起來。

根據1957年灣區捷運委員會的建議，州議會將Alameda, Contra Costa, Marin, San Francisco, 和 San Mateo劃入捷運系統範圍，經費來源為向這五個縣的居民課稅，並發行債券。正當大家熱烈討論電車的最高時速每小時75-80英哩，平均時速45英哩(含 靠站)，採用更進步的剎車及推進系統，安全堅固車廂及高級舒適內裝，舒適方便的車站地理位置與建築外觀…..的時候，San Mateo縣卻因新計劃費用龐大，加上認為現有的運輸服務”Southern Pacific commuter trains”已經足夠，而於1961年退出捷運計劃。1962年Marin縣也因稅金不足以支持捷運計劃而退出，另一項原因則是「你覺得火車通過金門大 橋，可行嗎？」

現在只剩三個縣參與這個計劃了，又經過各種公民投票表決之後，通過了改 為連結舊金山市與東灣Contra Costa和Alameda縣的捷運計劃。這項計劃耗資七億九千兩百美元，之後仍繼續追加。全長七十一點五英哩，包括33個車站，連接三個縣內的17個社 區。這項計劃還包括了重建部份的Muni輕軌列車系統：Muni與BART在舊金山Market Street交會，並共用車站，連接成一個完整的交通網。這是全美最大的地方交通工程。

BART 工程於1964年6月19日正式動工，由詹森總統(President Lyndon Johnson)在Contra Costa縣主持破土典禮。直到1972年通車之前，BART締造了許多記錄，如全美第四長的車用隧道，全國第一個全自動列車控制系統等等，這項工程在當 時並創造了超過5000個工作機會，每週工資超過一百萬美元。

1972年，BART的Fremont-MacArthur段通車，9月1日，BART載運第一位收費乘客，自此BART正式負起舊金山灣區的運輸重任至今。

2004年2月9日，BART機場線通車。

海底隧道：
長3.6英哩
24英呎高
48英呎寬
雙向
位於水平面下75英呎至135英呎深
高度防震

共有39個車站：
14個地下車站
12個平面車站
13個高架車站

造價：
$1,443,000,000 (不含海底隧道) + $176,000,000 (海底隧道)
= $1,619,000,000 (十六億一千九百萬美元)

停車場
除了Lake Merritt站收費0.25元美金，BART車站的所有停車場均可免費停車。由於一位難求，部份停車場劃分不同時段，若不小心停入不對時段的車位，必定大吃罰單！ (2016年, 幾乎所有的停車場都要收費了)

腳車上車指南
-腳踏車可以帶上BART，但某些特別註明的尖峰時段除外。
-第一節車廂不可進駐，亦不可擠入擁擠車箱。
-車站內不准騎車，必須使用樓梯或電扶梯，不准使用電梯。
-14歲以下騎士需有大人陪同。
-車廂內必需禮讓殘障老弱婦孺，不可霸佔博愛座，亦不可擋住出入口。